Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AIREO43918 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
AIREO43918 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
AIREO43918 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
AIREO43918 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
AIREO43918 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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