Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD28O15084 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD28O15084 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms