Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAMP3O14828 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAMP3O14828 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SCAMP3O14828 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCAMP3O14828 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms