Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRPO00591 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRPO00591 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRPO00591 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms