Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPBD1B2RD01 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms