Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A8MVJ9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
A8MVJ9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
A8MVJ9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
A8MVJ9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms