Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL33A6NCF5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL33A6NCF5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms