Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC144AA2RUR9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms