Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FZD4Q9ULV1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms