Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP25Q9UHP3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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