Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms