Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
POLR2J2Q9GZM3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2J2Q9GZM3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms