Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
VN1R3Q9BXE9 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VN1R3Q9BXE9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms