Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYCP2Q9BX26 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms