Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUN5

CCDC28B, Coiled-coil domain-containing protein 28B, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC28BQ9BUN5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC28BQ9BUN5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms