Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A3Q9BRY0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms