Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
RHOXF2Q9BQY4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RHOXF2Q9BQY4 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms