Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NIPSNAP1Q9BPW8 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NIPSNAP1Q9BPW8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NIPSNAP1Q9BPW8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NIPSNAP1Q9BPW8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NIPSNAP1Q9BPW8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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