Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PKP4Q99569 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PKP4Q99569 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP4Q99569 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP4Q99569 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP4Q99569 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PKP4Q99569 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms