Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIN3AQ96ST3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SIN3AQ96ST3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms