Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DCLRE1CQ96SD1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms