Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SNX18Q96RF0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms