Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
RNF185Q96GF1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms