Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHF21BQ96EK2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms