Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CAVIN3Q969G5 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CAVIN3Q969G5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms