Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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USP9XQ93008 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
USP9XQ93008 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
USP9XQ93008 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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USP9XQ93008 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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USP9XQ93008 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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USP9XQ93008 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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USP9XQ93008 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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USP9XQ93008 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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USP9XQ93008 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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USP9XQ93008 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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USP9XQ93008 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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USP9XQ93008 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
USP9XQ93008 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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