Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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UBXN4Q92575 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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UBXN4Q92575 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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UBXN4Q92575 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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UBXN4Q92575 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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UBXN4Q92575 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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UBXN4Q92575 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
UBXN4Q92575 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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