Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TMIEQ8NEW7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMIEQ8NEW7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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