Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF548Q8NEK5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF548Q8NEK5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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