Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PIK3C3Q8NEB9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PIK3C3Q8NEB9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms