Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
APCDD1LQ8NCL9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms