Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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RNF182Q8N6D2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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RNF182Q8N6D2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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RNF182Q8N6D2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RNF182Q8N6D2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
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