Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG10Q8N0Z9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms