Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms