Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDXQ7Z353 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms