Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC174Q6PII3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms