Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM236Q5W0B7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms