Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TDRD12Q587J7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TDRD12Q587J7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms