Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
ANKRD39Q53RE8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms