Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms