Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CTXN3Q4LDR2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTXN3Q4LDR2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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