Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM16Q2WEN9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms