Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Q1T7F1 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Q1T7F1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Q1T7F1 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Q1T7F1 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Q1T7F1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Q1T7F1 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Q1T7F1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Q1T7F1 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Q1T7F1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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