Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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