Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CRY1Q16526 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms