Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms