Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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NEDD8Q15843 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NEDD8Q15843 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NEDD8Q15843 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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