Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LSAMPQ13449 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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