Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPRJQ12913 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
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