Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CHD3Q12873 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CHD3Q12873 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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